GMP車間凈化工程潔凈廠房建筑方式可分為土建結構和裝配式兩種，其中普遍采用裝配式。裝配式潔凈廠房系統主要由初，中，高三級空氣過濾的空調送風回風和排風系統；動力及照明系統；工作環境參數的監測報警消防和通訊系統；人流和物流系統；工藝管路系統；維護結構及靜電地面處理等各方面所要求的實施內容組成，形成空調凈化系統工程所包含的整個設備和器材的配套和建筑安裝內容。GMP凈化工程車間內的操作臺，傳送帶，運輸車，工器具應當用無毒，耐腐蝕，不生銹，易清洗消毒，堅固的材料制作。應當在適當的地點設足夠數量的洗手，消毒，干手設備或用品，水應當為非手動開關。